העץ הוא חומר חמים מבחינת המראה שלו ומעניק אווירה כפרית. לפרגולות העשויות מעץ יש ביקוש רב הודות לנראות שלו.

 בהתאם לסוג העץ והפרגולה אפשר לקבוע כל כמה זמן ידרשו עבודות תחזוקה. ניקיון ובדיקת שלמות הפרגולה יתבצעו באופן קבוע. צביעה, הגנה ושיוף יכולים להתבצע אחת ל 4 שנים.

 אפשר לשתול בקרבת הפרגולה צמחים שונים וגם לשים עליה מטפסים. עם זאת יש לשים לב כי לא מומלץ להשקות בקרבת יסודות הפרגולה באופן קבוע ולנסות להרחיק מעט את מקור המים וזאת כדי לשמור על העץ.

 ישנם עצים רבים שניתן להשתמש בהם לצורך בניית הפרגולה כולל אורן, עץ גושני, איפאה ואחרים. כל עץ מגיע עם דרישות שונות ובחלק (כמו האיפאה) יש צורך גם במכונות עבודה ייחודיות והבנה ספציפית בסוג העץ.

התחזוקה של פרגולות עץ יכולה להיות פשוטה וזאת בתנאי שמבצעים אותה בצורה הנכונה. יש לנקות את העץ בעדינות, לאטום אותו אם נראים סדקים ואחת לתקופה (בהתאם לסוג העץ) להוסיף שכבת הגנה וצבע לחידוש.

 ההחלטה לגבי הקירוי צריכה להתקבל בהתאם לעיצוב הרצוי, התקציב וגודל הפרגולה. אפשר להשתמש ברפפות עץ ואפשר להשתמש בסרגלי עץ" + בחומר פלסטי - פוליגל.

.כמו כן ניתן לכסות את החלק העליון בחומר פלסטי כך שניתן יהיה לשבת תחת הפרגולה גם בחורף בלי חשש מהגשם.